Malnava mõisat on ajalooürikutes esmakordselt mainitud 1774. aastal. Klassitsistlikus stiilis hoonel esinevad ka baroksed elemendid. Suuruse poolest meenutab mõis pigem villat või häärberit. Mõisakompleks on rajatud sümmeetriliselt ümber peahoone ees asuva ringikujulise platsi, kuhu viib sissesõidutee alguses olev värav. Ringtee ühel küljel asub ait. Härrastemaja sai Teise maailmasõja ajal tugevasti kahjustada. Hoone taastamistööde käigus ei säilitatud algset sisekujundust. 1928. aastal lisati hoonele külgkorpused, et kohandada seda vastavalt Põllumajanduskooli vajadustele.
Mõisa majandushoonetest on säilinud mitmed ehitised, sh 19. sajandi esimesel poolel ehitatud klassitsistlik ait, mille fassaadil on kaks nelja sambaga portikust. Mõisakompleksi täiendab suur park, kus on endiselt säilinud eksootilisi põõsaid ja puid.